不过，在卢浮宫的拍摄，遇到的麻烦可远远不止来自于剧组本身的问题。
根据协议规定，剧组每天的拍摄素材必须在当地警员的监督下，原地封存，并于第二天转交给卢浮宫馆长亨利·卢瓦雷特。
经过卢浮宫馆方专业人士的逐帧审核过后，如出现一些不方便公布的细节，则必须无条件删除，然后才能再返还给剧组的手中，作为电影的有效素材。
在第四天的馆内拍摄进程中，当卢浮宫馆长在看到前一天的拍摄素材后，特意发来传真，在剧本的情节中严令要求删除“《蒙娜丽莎》镜像反转出黑爵士头像”的相关情节。
语气与措辞非常严厉：“《蒙娜丽莎》是世界着名的艺术珍品，这样的处理方式是对艺术的亵渎，会误导观众。”
但是这就让李陆难办了，这个情节是原着中最为关键的部分，也是电影的亮点之一，甚至于其镜像反转的cG特效，远在米国的工业光魔已经开始建模扫描并渲染了。
如此重要的特效镜头，李陆还是交给工业光魔制作更放心些。
他很清楚，自己刚刚初创的特效制作部，还没办法承担如此重要的工作。
在反复的与远在大洋彼岸的工业光魔的项目经理沟通后，最终李陆采取了一个相对折衷的方案：保留镜头，但弱化轮廓，让观众觉得是自己的想象，而不是电影的刻意呈现。
接到修改指令的cG特效师，开始不断调整镜像画面的对比度：“我会反复尝试，找到最合适的效果，既保留情节，又不会引起过多争议。”
而李陆也把这个两全其美的解决方案报给卢浮宫的馆方进行审批，在得到馆长亨利·卢瓦雷特的批准后，李陆总算是长舒了一口气。
此时此刻，远在米国旧金山莱特曼数码艺术中心的工业光魔的cG特效工厂内，跟组的副导演和特效师一遍又一遍地调整着画面。
在尝试了几十次的重构与渲染后，当看到蒙娜丽莎的微笑与达·芬奇自画像的轮廓若隐若现时，副导演终于满意地笑了：“李导要的就是这个效果！让观众在疑惑中探索，这才是《达·芬奇密码》的魅力所在。”
当然，影片拍摄遇到的麻烦是来自方方面面的。
作为雷·提彬居住的城堡，距离凡尔赛宫附近的巴黎西北部35公里的威利特城堡，也是取景的重头戏。
不过城堡的主人有个要求，那就是不准对书房的壁炉有任何形式的触碰。
在《达·芬奇密码》的原着中，很多书迷都以为那里藏着拱顶石，这要是被破坏了，会引起很大麻烦的。
为此，剧组不得不用临时的铁栏杆将壁炉给拦起来，等到后期特效制作时，再行去除。
道具组在布置书房场景时，突然发现城堡原有的壁画与剧本中的描述，当然也与小说的原着不符。
不知道是不是作者丹·布朗为了拉满小说的悬疑效果，而特意虚构了小说的情节？
总之，这给李陆造成了很大的困扰。
维持实景拍摄吧！和小说原着不符。
按照原着拍摄吧！又和现场事物不符。
剧本里要求书房墙壁上有圣杯与圣母重叠的图案，但城堡里的壁画是关于中世纪战争的，如果不修改，会直接影响剧情的连贯性的。
甚至会给观众呈现出一种不和谐割裂感，严重影响影片营造出的那种悬疑氛围。
李陆看了看手表，已经下午四点了，距离明天的拍摄还有一整晚的时间。
“马上联系画师，让他们连夜在书房墙壁挂上画布，绘制圣杯与圣母重叠的图案，”李陆果断地做出决定，“我会调整拍摄计划，先拍摄其他场景，给画师争取时间。”
这种高仿四五百年前欧洲名家画作的画家，在巴黎这座世界艺术之都，有很多。
尤其是那些地下画廊，有着批量生产的一整条灰色产业链。
画师们赶到后，立刻开始工作。
他们先用铅笔勾勒出图案的轮廓，然后调配颜料，小心翼翼地绘制着。
直到第二天早晨，壁画终于绘制完成.
当剧组人员齐聚画布前欣赏之时，大家都为画师精湛的画功所征服。
其实绘画的复杂图案并不难，难就难在要在画布上呈现出壁画的感觉，一切的光影明暗与壁画的纹理，都需要严丝合缝。
在众人的眼里，这就是一幅完完整整的真迹壁画，而非画布上呈现的赝品。
画布上的颜料还未完全干透，但在这些专业人士看来实在是小菜一碟。
将专业的烤灯调整到特定的频率，按照画师的说法，肯定能赶在中午前，将颜料与油墨干透。
“太好了，赶上了！”李陆看着壁画，兴奋地说，“我们中午就可以开始拍摄兰登和索菲解读壁画密码的场景了，大家都打起精神来！”
之后，在拍摄“兰登解读城堡密码”的戏份时，意外发现剧本里描述的“斐波那契螺旋线”与城堡实际的建筑结构不符。
城堡的楼梯扶手是直线设计，而剧本里要求楼梯扶手呈现螺旋线，与密码图案呼应。
“如果按照实际结构拍摄，观众会觉得很突兀，”李陆拿着剧本，对道具师说，“兰登是符号学专家，他不可能忽略这么明显的结构问题。”
李陆看着楼梯扶手，陷入久久的沉思，好半晌才对道具师说：“在楼梯扶手外侧加装一层可拆卸的螺旋形扶手，用轻质材料制作，拍摄结束后再拆下来。另外，在楼梯台阶上贴一层印有螺旋线图案的贴纸，通过镜头角度和打光，让螺旋线看起来像是扶手和踏步的一部分。”
道具组立刻行动，对于好莱坞的专业人士，他们会随组准备大量的模型材料。
在十几个人的齐心协力下，只用了半天的时间就迅速的完成了楼梯的改造。
当李陆扶着螺旋形扶手走下来，手指抚摸着扶手表面光滑的螺旋线时，他是真的不得不感叹于好莱坞剧组拍摄工业化的强大。
同样的问题，如果在国内，估计剧组至少要趴窝三五天。
而在这里，时间不足六个小时，就已经圆满的解决了。
现场拍摄尽管困难重重，好在全剧组的人员齐心协力，将困难一一化解。